云南中医学院成立于1960年， 是全国第二批成立的高等中医药本科院校。1986年获硕士学位授予权，2007年获教育部本科教学工作水平评估“优秀”，2008年被确定为省级立项建设博士授权单位。目前，学校是一所以中医药学科为主体，医、理、工、管多学科协调发展，以本科教育为主，研究生教育、继续教育、对外教育共同发展的高等中医药本科院校。
学校现有教职工680人，其中，专任教师591人，国家级专家19人，省级专家40人，博士学历101人。有全日制学生10306人，其中，本科生9472人，研究生780人，留学生54人；各类成人教育学生 9655人。学校拥有两个校区，占地面积763.20亩，其中呈贡校本部730.33亩，白塔校区32.87亩，总建筑面积27.3万㎡。学校现有11个二级学院、2个公共课教学部、1个实验中心、1个研究院。有17个国家中医药管理局重点学科、7个省级重点学科、2个省级优势特色学科，2个省级“十二五”立项建设博士学位授权一级学科。有4个一级学科硕士学位授权点（涵盖22个二级学科）和4个专业硕士学位授权点。有21个本科专业，其中，国家级特色专业2个、综合改革试点专业1个，省级重点、特色专业各5个、综合改革试点专业3个。
学校有一批省级教学科研平台和校地、校企、校院共建平台，是省中医药国际教育基地、国际科技合作基地。有省中医药产业研究院、省中医药政策研究中心、省民族医药保护与产业发展研究基地、6个省高校重点实验室和工程中心、1个省2011协同创新中心，1个省中医临床研究基地，2个省级专家工作站，是省优势中药材规范化种植工程研究中心主要成员单位。学校和省内外医院、药企合作建立了118个医药学类实践教学基地。
学校是国家教育信息化试点单位，云南省中医药民族医药信息资源中心，图书馆藏书79万册，线装古籍图书1.8万册， 电子资源总量36TB，中外文数据库25个，信息资源服务覆盖全省118个医药学类实习基地。校内建有云南省中医中药博物馆，是国家中医药文化宣传中心，省科普教育基地。
建校55年来，学校培养了中医药民族医药及相关人才5万余人，一批研究成果，为我省中医药事业和产业提供了有力的人才和技术支撑，为人民健康做出了重要贡献。