包头医学院成立于1958年，是新中国在少数民族地区较早建立的普通高等医学院校之一。2003年6月，经国家教育部批准，原包头医学院、原包头钢铁学院和原包头师范学院合并组建内蒙古科技大学。2004年12月，又经内蒙古自治区人民政府批准，内蒙古科技大学分为三个具有独立法人资格的办学实体，原包头医学院更名为内蒙古科技大学包头医学院。经过50 年曲折历程，包头医学院已发展成为一所有特色有影响的区属高等学校，共培养各级各类人才2万多名，为内蒙古自治区经济发展、社会进步和医药卫生事业做出了积极贡献。