生物工程专业培养掌握生物工程原理、工艺技术和工程设计等基础理论、基本技能，能在生物工程领域从事设计、生产、管理和新技术、新产品研发的高级专门人才。毕业生可在科研院所、高等院校、生物工程、生物化工、发酵食品及生物制药等相关单位从事现代生物工程技术的研究开发，生物产品的生产、工艺设计、过程控制、管理、营销和教学等工作。 本专业授予工学学士学位，在生物化学与分子生物学学科具有硕士学位授予权。
主要课程：无机及分析化学、有机化学、物理化学、普通生物学、生物化学、微生物学、化工原理、工程图学、化工制图、机械设计、生物工艺学、生物工业分析、生物工程设备、生物工厂设计等。