会计学专业
该专业重点培养具有扎实、宽广的专业基础，掌握国际会计惯例和专业知识，适合在大中型企业、会计师事务所、政府机构、金融机构等单位从事实际工作，并具有持续和灵活发展潜力的会计管理人才。
会计学专业开设的主干和选修课程主要包括：会计学、中级财务会计学、成本会计学、管理会计学、财务管理学、审计学、高级财务会计学、税务会计与税务筹划、会计制度设计、非盈利组织会计、会计理论、会计专业英语、计算机会计、金融会计、财务战略、人力资源会计、财务报表分析、会计专题讲座等。其中会计学课程已经被批准为校级示范精品课程。
本专业已毕业学生以良好的基础素质、专业知识和综合能力赢得用人单位的好评，社会需求明显，每年的就业形势乐观，在商学院各专业毕业生中，会计学专业的毕业生就业率始终名列前茅。在学生选择的就业单位中，绝大部分是国家政府机关、大型跨国公司、上市公司等。 本专业2011届毕业生就业率为100%，其中31.43%被免试推荐及考取研究生或出国留学。
国际会计方向（CGA）
该专业方向是南开大学商学院与加拿大注册会计师协会（CGA,Certified General Accountants Association of Canada）合作培养的一个专业方向，目标是：培养有系统理论基础知识、实际操作技能、专业道德和敬业精神、通晓国际会计惯例的高级会计管理人才。国际会计专业的特色是以合作办学为契机，采用循序渐进、全过程专业课双语教学的模式。
国际会计专业执行合作教学计划。
在合作教学计划中，由南开大学和加拿大注册会计师协会合作开设15门课程。其中，6门公共基础课程使用南开大学原定教材，加拿大注册会计师协会承认学分；9门专业课程使用全英文教材，由南开大学老师讲授，这9门课程包括FA1（会计学基础）、FA2（中级财务会计-上）、FA3（中级财务会计-下）、FA4（高级财务会计）、MA1（成本会计）、MA2（管理会计）、FN1（财务管理基础）、AU1（审计学基础）、AT1（会计理论）。其中部分课程由加拿大教授进行重点辅导，最后由南开大学老师命题考试。
CGA提供这9门专业课程的全套国际化教材以及与课程相配套的光盘和阅读资料，会计系根据中国会计改革内容的发展情况，提供或指定配套的中文参考文献。
国际会计专业方向的毕业生的就业形势非常好。除了继续攻读研究生和出国深造的毕业生之外，其他同学的就业领域主要是大型跨国公司，大型会计师事务所、上市公司、政府机关、银行等。
本专业2011届毕业生就业率为100%，其中30.51%被免试推荐及考取研究生或出国留学。